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Notre étude est basée sur l'analyses des données physico-chimiques, hydro-biologiques, de la pêche maritime de la région de Mostaganem, et par analyse multi- variée en utilisant le logiciel statistique "R libre" qui a permis de mener une étude comparative à grande échelle sur une période de deux années (2009 et 2010), de manière à caractériser les écosystèmes où opèrent les apports d'Oued Chéliff en nutriments (N, P, Si) et de polluants provenant de l'environnement urbain, agricole et industriel. Notre suivi a révélé la présence de substances azotées, phosphorées et soufrées et une concentration importante en matière en suspension au niveau de l'oued Chéliff. La biodiversité des organismes phytoplanctoniques a été discutée et comparée entre les deux milieux « Oued Chéliff et la Baie de Mostaganem ». Par ailleurs, l'état de l'abondance des ressources halieutiques des pêcheries de Mostaganem a été analysé et discuté en quantifiant la production halieutique en relation avec la disponibilité des nutriments et des organismes phytoplanctoniques autotrophes en tenant en compte la présence ou de l'absence de la connectivité "Oued Chéliff - Baie Mostaganem"
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